Docking@Home — проект добровольных вычислений, работающий на платформе BOINC. Проект организован университетом Делавэра. Основной задачей проекта является моделирование взаимодействия потенциальных лекарственных средств с белками (докинг).[1] 7 апреля руководство Docking@Home объявило о закрытии проекта, состоявшегося 23 мая 2014 года.[2]
Докинг
Молекулярный докинг представляет собой поиск лиганд-белковых комплексов, имеющих минимальную свободную энергию, то есть таких, компоненты которых оптимальным образом «подходят» друг к другу. Поиск таких комплексов — задача, которая хорошо распараллеливается, и поэтому подходит для распредёленных вычислений.[3] В проекте Docking@Home моделирование связывания лиганда с сайтом связывания белка проводится при помощи программного модуля CHARMM. Процесс состоит из нескольких независимых попыток с различной пространственной ориентацией и конформацией лиганда.[1]
Детали проекта и статистика
Научные достижения
Примечания
- ↑ 12http://ieeexplore.ieee.org/xpl/freeabs_all.jsp?arnumber=4228396Архивная копия от 27 марта 2014 на Wayback MachinepdfАрхивная копия от 10 июня 2010 на Wayback Machine
- ↑ Новость о закрытии проектаАрхивировано 17 октября 2014 года.
- ↑Stephen Childs; Luc Bouge; Martti Forsell; Träff, Jesper; Achim Streit; Ziegler, Wolfgang; Alexander, Michael Van Cleave.Euro-Par 2007 Workshops: Parallel Processing: HPPC 2007, UNICORE Summit 2007, and VHPC 2007, Rennes, France, August 28-31, 2007, Revised Selected Papers (Lecture Notes in Computer Science) (англ.). — Berlin: Springer, 2008. — P. 85. — ISBN 3-540-78472-1.
См. также
Ссылки
.svg){kind=small}
